本季是《航海家号》全剧的第一个重要转折点。虽然航海家号依旧在陌生的德尔塔象限中航行、探索，但舰长和船员们遇到了前所未有的挑战，他们发现博格人（曾是星际联邦历史上最恐怖的对手和敌人）的存在并最终进入博格人的领地，然而博格人正在与更恐怖的种族“8472”交战。在开发出对抗“8472”的武器后，航海家号决定与博格结盟。本季大结局的续篇是第四季第一集，经典角色“九之七”在那一集中首次登场。Borg终于上线了，Kes突然变长发好不习惯，她的故事线也开始变奇怪了星际迷航是一个非常大的坑，要不是看到生活大爆炸里的谢耳朵如此的推崇星际迷航，我也不会在几个月之内，看完50多年来这么多的星际迷航电视剧以及电影！啊……我喜欢这代的领航员。不是TNG的那个。終於出現一個邪惡又強大的非類人種族了。
